Fornleifastofnun Íslands gefur út fjöldann allan af skýrslum á hverju ári.  Lista yfir skýrslurnar má sjá hér til hliðar.  Flestar þeirra er hægt að kaupa á skrifstofu stofnunarinnar.

Stofnunin hefur gefið út ritið Archaeologia Islandica síðan 1998.  Í því má finna margvíslegar greinar, flestar á ensku, fyrst og fremst um íslenska fornleifafræði.  Ritstjóri er Gavin Lucas.

Fornleifastofnun gefur einnig út  Ritröð Fornleifastofnunar Íslands. Nú nýverið kom út fyrsta bókin í ritröðinni. Hún fjallar um umfangsmikila fornleifarannsókn á Hofstöðum í Mývatnssveit. Nánar má lesa um bókina hér til hliðar.